呼伦贝尔生态产业技术研究院（以下简称生态院），是内蒙古自治区首批建设的，16家新型科技研究开发机构之一。成立于2013年9月，注册资金3000万元，呼伦贝尔农垦集团是其建设的主体企业。建设伊始，农垦集团集农垦所有科技优秀资源充实该生态院，在农垦集团改革发展进程中，将搭建科技平台，作为打造绿色食品产业航母的四大平台之首，将生态院列为航母启航的助推器、大健康产业的孵化器，高端人才引进培养成长的摇篮。先后成立了自治区级“现代农牧业科技示范园区”、“呼伦贝尔生态农牧业研究开发中心”、“呼伦贝尔农垦高技术产业化高层次人才创新创业基地”。建成了《现代都市高寒区设施农业示范园》。

新品系新品种选育产出增加：2017年引进农作物、牧草、中草药等经济作物新品种225个；申报省级品种审定区试的大豆品种4个、小麦品种4个；申报全国极早熟春玉米区试联合体早熟玉米品种2个；参加自治区油菜品种登记备案区试的有7个；培育杂交玉米新品种组合147个。建设南繁基地6.8亩，其中小麦育种加代材料3600份，油菜育种加代材料901份，加代繁殖9个品种。开展了分子育种、航天育种、油菜杂交育种等研究和试验。

呼伦贝尔生态产业技术研究院以呼伦贝尔区域经济社会问题和需求为导向，坚持三个面向：面向农垦生产主战场，面向国内外前沿科技，面向可持续发展的产业市场；突出三个着力：着力突破地区经济社会发展中的重大关键共性技术，着力增强区域生态产业核心竞争力，着力提高依托企业自主创新能力。生态院组建近三年来，在自治区科技厅、呼伦贝尔市政府和呼伦贝尔农垦集团的的高度关注和大力支持下，生态院依托呼伦贝尔农垦集团优势资源、优势产业，积极探索开放、竞争、流动、共享的管理体制和运行机制，逐步建立了“政产学研金”合作机制，紧紧围绕内蒙古自治区创新驱动发展战略，围绕呼伦贝尔大型绿色农畜产品加工基地和生态屏障建设使命，围绕呼伦贝尔农垦集团公司发展目标和改革实际需求，适应国家经济建设新常态要求，努力打造农牧业高科技平台，积极营造区域大众创新万众创业新局面。